داستان درباره آینده است زمانی که جان کانر (Christian Bale) بزرگ شده و حالا فرماندهی گروه مقاومت را به دست گرفته ولی خطری بزرگ تر نسل انسان ها را تهدید می کند و آن این است که ماشین ها توانسته اند به ساختاری دست پیدا کنند که انسان ها نیز تبدیل به ماشین شوند و...